В 1838 году Коряковский форпост был преобразован в станицу. В этом же году было получено благословение от Тобольской духовной консистории на постройку церкви, и в 1841 году в станице была построена деревянная на каменном фундаменте церковь, освященная в честь святых Флора и Лавра. Церковь строилась тщанием купца 3-й гильдии Петра Ивановича Токарева с помощью прихожан. Храм находился на базарной площади (в настоящее время – территория торгового дома «Старый город» и новостроек), в которую упиралась Церковная улица.
В «Ведомости о церкви Флоро-Лаврской Семипалатинского ведомства форпоста Коряковского за 1841 год» приводятся следующие сведения о новопостроенной церкви:
«1-е) Построена 1841 г. старанием 3-й Гильдии купца Токарева с помощью прихожан.
2-е) Зданием деревянная на каменном фонтименте[1] с таковою же колокольнею, крепка.
3-е) Престол в ней один в настоящей теплой во имя Святых Мученик[ов] Флора и Лавра.
4-е) Утварью посредственна.
5-е) Причта положено: один священник и два причетника.
6-е) Земли при сей церкви пахотной по неудобству производить хлебопашество не имеется, и усадебная, и сенокосная есть.
7-е) Дом для священника приготовляется новый на общественной земле, а причетник живет на квартире.
8-е) На содержание священно-церковнослужителей получается жалованья от казны 320 рублей, содержание их не очень достаточно.
9-е) Зданий, принадлежащих к сей церкви нет.
10-е) Расстоянием сия церковь от Консистории в 1103-х верстах, от Духовного Правления, равно и от местного Благочинного – в 303-х верстах.
11-е) Ближайшая к сей церкви суть Ямышевская Иоанно-Богословская в 47-ми верстах и Песчанская Пророко-Ильинская – в 94-х верстах.
12-е) Приписной к сей церкви нет.
13-е) Домовой в сем приходе церкви нет.
14-е) Опись церковному имуществу есть, сделана 1841 г. и скреплена Первоприсутствующим Семипалатинского Духовного Правления протоиереем Любомудровым и утверждена печатью оного Духовного Правления.
15-е) Приходорасходные книги о суммах свечной и церковной за шнуром и печатью Духовного Правления даны в 1841 году и хранятся в целости.
16-е) Копии с Метрических книг с 1838 г. хранятся в целости.
17-е) Исповедные росписи с 1838 г. хранятся в целости.
18-е) В обыскной книге, выданной за шнуром и печатью Семипалатинского Духовного Правления 1841 г. Октября 20 дня, и скрепленной Первоприсутствующим протоиереем Любомудровым, писанных листов – пять, а не писанных – 32 листа».
В 1886 году в Флоро-Лаврской церкви был произведен ремонт: снаружи церковь была окрашена масляной краской, внутри исправлена штукатурка потолков и стен, потолки и стены по штукатурке были оклеены холстом и бумагою и выбелены мелом, во всем здании полы, двери, косяки, рамы, колонны и три крыльца выкрашены заново, исправлены главы и кресты, подновлены иконостас и некоторые иконы, заготовлен тес для оградки.
В 1890 году ветхие купола с крестами были заменены на новые.
Церковь была обнесена оградой и к ней прилегала свободная площадь, часть которой была занята кладбищем, а на другой совершались молебны, проводились плацпарады и обучение казаков.
24 мая 1901 года в Павлодаре произошел сильнейший за всю историю города пожар, в котором сгорело две трети города. Вся деревянная часть города полностью выгорела. В пожаре сгорела и казачья Флоро-Лаврская церковь.
[1] Так в документе, нужно: фундаменте.